AlphaFold para niños

Datos para niños AlphaFold
Información general
Tipo de programa	Modelo de inteligencia artificial Predicción de la estructura de las proteínas
Desarrollador	Google DeepMind
Modelo de desarrollo	Código abierto
Lanzamiento inicial	2018
Licencia	Apache 2.0 License
Información técnica
Programado en	Python
Versiones
Última versión estable	2.3.25 de abril de 2023
Enlaces
Sitio web oficial Repositorio de código

AlphaFold es un programa de inteligencia artificial (IA) desarrollado por DeepMind de Alphabet que realiza predicciones de la estructura de las proteínas mediante el sistema de aprendizaje profundo.La primera versión de AlphaFold, conocida como AlphaFold 1, obtuvo el primer lugar en la clasificación general de la 13.ª edición de la competición CASP (Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction, 'evaluación crítica de técnicas para la predicción de la estructura de proteínas') en diciembre de 2018. El programa se destacó particularmente en las predicciones de estructuras para las que no existían modelos previos, consideradas por los organizadores de la competición como las más difíciles.

AlphaFold 2, versión desarrollada en 2020, volvió a ganar la competición CASP en noviembre de 2020, con predicciones mucho más exactas que las de cualquier otro programa. En alrededor de dos tercios de las proteínas, AlphaFold 2 obtuvo una puntuación superior a 90 en la prueba de distancia global (GDT), que compara las predicciones de los programas con las estructuras determinadas experimentalmente; una puntuación de 100 denota una coincidencia completa.

Los resultados de AlphaFold 2 en CASP han sido calificados como «asombrosos» y «transformadores». Aunque la exactitud de las predicciones no es lo suficientemente alta en un tercio de los casos y el programa no revela ninguna información sobre el mecanismo del plegamiento de las proteínas, el logro técnico ha recibido un reconocimiento generalizado.

El 15 de julio de 2021, Nature publicó un artículo sobre AlphaFold2 junto con software de código abierto y una base de datos de búsqueda de proteomas de varias especies.

Aplicaciones

AlphaFold se ha utilizado para predecir varias estructuras de proteínas del SARS-CoV-2, el agente causante de la COVID-19. A raíz de la pandemia, existe un gran interés en la determinación experimental de las estructuras de estas proteínas desde principios de 2020. Un equipo de científicos del Instituto Francis Crick en el Reino Unido examinó las predicciones antes de publicarlas para la comunidad entera de investigadores. El equipo reconoció que, aunque las estructuras podrían no ser necesarias para las investigaciones terapéuticas en curso, ayudarían a entender mejor la biología del virus. También confirmaron que la estructura de la proteína ORF3a predicha por AlphaFold 2 se asemejaban mucho la estructura determinada por microscopía crioelectrónica en la Universidad de California, Berkeley. Esta proteína ayuda a los virus replicados a salir de la célula huésped y se piensa que participa en el desencadenamiento de la respuesta inflamatoria a la infección.

Véase también

En inglés: AlphaFold Facts for Kids